O período de formação na França consolida a predileção pela pintura histórica e lhe dá as bases para uma compreensão mais ampla do papel da arte decorativa, que Braga observa em meio a voga do art noveau. Tal como o pintor Eliseu Visconti (1866-1944), Braga foi atento à produção de Eugène Grasset (1841-1917). A partir de 1905, utiliza formas mais geometrizadas em obras decorativas. Compõe um rico repertório de ornamentos intitulado A Planta Brasileira (Copiada do Natural) Aplicada à Ornamentação (1905), com aquarelas de elementos da flora, fauna e de motivos marajoaras, seguidos de suas estilizações em composições decorativas.

O interesse pelo folclore está a par com a importância dada à história. Em seus escritos sobre a história do Pará, enfatiza o papel do indígena na constituição da cultura local. A pintura Fundação da Cidade de Nossa Senhora de Belém (1908) apresenta a chegada da frota de Castelo Branco (1566-1619) à cidade. Em meio à cultura efervescente, propiciada pelo ciclo da borracha, a obra gera grande expectativa na elite local. Sua apresentação ocorre no Teatro da Paz, durante a comemoração do aniversário de seu encomendante, o intendente Antônio Lemos (1897-1911). Para a execução, o artista realiza extensa pesquisa histórica, apresentada na nota explicativa da pintura. A produção coincide com um momento de reconfiguração da historiografia da região amazônica, que busca reconhecimento territorial e a inserção na história nacional. Com atenção a cada personagem, natureza e cor local, a obra representa o marco fundador de uma identidade amazônica.

Os temas históricos que pinta enfatizam o caráter discursivo, como o tríptico Périplo Máximo de Antonio Raposo Tavares (1928), pertencente ao Palácio Bandeirantes, em São Paulo. Pinta as obras Anhanguera, Padre Provincial Alexandre de Gusmão e Padre Antonio Vieira (1917), nas quais percebe-se uma tentativa de aproximação entre pintura e história.

A partir dos anos 1910, promove o debate sobre a reformulação do ensino do desenho na Enba e no ensino regular de todos os níveis, defendendo a utilização de repertório nacional como modelos. Para Braga, a livre expressão deve estar alicerçada em estudo rigoroso desde os níveis primários de ensino.

Entre suas críticas ao programa de desenho do Colégio D. Pedro II em 1926, estão a desarticulação dos exercícios, a exigência de precisão à mão livre em anos iniciais da formação, a cópia exaustiva de sólidos geométricos e a pouca ênfase à perspectiva. Publica, em 1922, o artigo “Nacionalização da Arte Brasileira”, em que conclama a manifestação de um sentimento patriótico no campo das artes. Vê, na educação do operariado, a expansão do conhecimento das coisas pátrias, para que se possa “produzir arte nacional por artistas nacionais”, o que, segundo Braga, já está em curso nas belas artes, mas deficiente nas artes aplicadas. Para tal propósito defende a implementação do ensino artístico técnico, voltado às artes decorativas, tendo como disciplina fundamental o desenho específico para cada ofício.

Seu programa para o ensino da arte decorativa é implementado pelo artista Carlos Hadler (1885-1945) no curso de Pintura da Escola Profissional de Rio Claro a partir de 1927. Esse sistema, segundo Braga, dá suporte a um estilo nacional já conhecido pelos indígenas.